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El Centro de Saneamiento de Citrus, fue creado en 2003 y habilitado por el Instituto Nacional de Semillas (INASE) en octubre de 2004, para la ejecución de tareas de limpieza y diagnóstico de virus en citrus, dando así continuidad, con ténicas actualizadas, a las actividades desarrolladas por la EEAOC desde su fundación en la provisión de material cítrico de propagación al Noroeste Argentino. Los laboratorios del CSC están integrados al Sistema de Gestión y Aseguramiento de la Calidad implementado por la EEAOC, sujeto a las auditorías y actualizaciones de rigor.
El CSC genera y mantiene, conservado y protegido con pruebas periódicas de plagas y enfermedades, un plantel de plantas madre -variedades copa y porta injertos- que se utiliza como fuente primaria del material de propagación de semillas y yemas registradas para la producción de plantas certificadas y como base del programa de mejoramiento.
El CSC provee asimismo servicios de diagnóstico de las enfermedades listadas en la reglamentación vigente (Res 149/98 de la SAGPyA) y otros, de asesoramiento y transferencia de conocimientos a través de las distintas modalidades -directa y personalizada, talleres, seminarios, medios gráficos y electrónicos- que al efecto son ya tradicionales en la rutina de esta Estación Experimental.