El Laboratorio de Aguas y Efluentes (LAE), brinda servicios de análisis fisicoquímicos de calidad y caracterización de aguas superficiales y profundas y de efluentes industriales. Además, trabaja en Planes de Investigación sobre “Tratamiento de efluentes y residuos orgánicos en la industria citrícola” y “Racionalización del manejo de aguas industriales”.